Os arredores do lago Mývatn son unha zona volcánica moi activa e se poden ver numerosas manifestacións, tanto antigas como moi recentes, desta actividade. Por exemplo, a paisaxe case marciana de Hverarönð está composta de fumarolas, pozas de lama fervendo e fontes de auga en ebullición que expulsan grandes cantidades de vapor sulfuroso, e todo o entorno está tinxido da cor amarela do xofre e impregnado do seu cheiro fétido.
A escasa distancia, o volcán de fisura coñecido como Krafla entrou en erupción por última vez no ano 1984 e cubreu de lava negra os restos das erupción anteriores de 1724 e 1975.
Gracias ás medicións dos movementos do chan, os científicos saben que a última erupción foi o preludio de unha moito maior que levan esperando desde o ano 1991, pero que aínda non se produciu. A pesar de que as erupcións volcánicas en Islandia son frecuentes, a próxima erupción de Krafla é especialmente temida polas características xeolóxicas deste sistema volcánico, que o fan potencialmente perigoso.
Outros volcáns da zona deron forma ao propio lago Mývatn, que ten unha peculiar costa moi recortada e numerosos illotes, froito de diferentes coladas de lava:
Destacan especialmente uns cráteres creados por enormes explosións de vapor que se produciron cando a lava incandescente cubriu a auga do lago.
